聚焦水産種質資源評價與保存，水産遺傳育種理論與技術，水産良種培育與擴繁優勢特色，研究水産動植物重要經濟性狀（如生長、抗逆、品質等）的遺傳規律及調控機制。研發人工改良水産動植物遺傳性狀的技術和途徑，通過改造水産動植物的遺傳結構，從而改變水産動植物表型性狀、提高經濟性能。開發水産業工程技術，研究水産動植物生殖活動及其調控規律和調控技術，研究制訂水産動植物繁殖人工調控技術标準和管理措施，以保證水産動植物健康繁殖、提高繁殖效率。面向經濟主戰場和國家糧食安全戰略，發揮學科方向在棘皮動物、貝類、藻類遺傳育種的國際領先優勢和産業引領作用，為加快推進國家種業振興，實現種業科技自立自強、種源自主可控提供支撐。